1959年：由印尼青年归侨周才喜等7人在厦门市侨联积极支持下，创办了“厦门华侨热带作物试验场”，场址设在厦门市鼓浪屿博爱路口（现改为鹿礁路）。

1961年：厦门华侨热带作物试验场（对外称厦门华侨亚热带植物引种场）划归正在筹建的厦门市植物研究所，选址鼓浪屿鼓声路4号。原厦门市副市长许祖义兼任筹建处主任,原厦门市科委副主任罗林、厦门大学严楚江教授兼任副主任。

1962年：厦门华侨亚热带植物引种场划归中国科学院华东亚热带植物研究所（1975年改名福建省亚热带植物研究所），受厦门市及该所双重领导。

1964年：中国科学院院长郭沫若亲临引种场视察指导工作，他充分肯定引种场创建的成绩，并风趣地说道:“从海外引进的优良品种，如能驯化推广成功，也不亚于一颗原子弹爆炸”。1976年：在中国科学院院长方毅的关心过问下，福建省革命委员会决定复办引种场，由福建省科委责成福建省亚热带植物研究所着手进行恢复重建工作。

1981年：中共厦门市委下达了【1981】154号文件，并召开大会，专为厦门华侨亚热带植物引种场落实政策，平反正名，极大地鼓舞了海内外侨胞和爱国人士报效祖国热情与决心，他们称赞共产党政策好，欢呼引种场重获新生。

1984年：厦门华侨亚热带植物引种场脱离福建省亚热带植物研究所，划归厦门市科委及厦门市侨办双重领导，并更名为“厦门华侨亚热带植物引种园”。1985年：组建了“厦门华侨园艺技术开发公司”，并以该公司为载体，由厦门市侨联牵线，与“香港缤纷园艺公司”合资100万港元创办了“厦门侨缤园艺公司”。开创了我国通过国际商业引进观赏植物（珍贵花卉）的先河。

1987年：我园主持的国家“七.五”重点工业性试验项目“农作物国外引种隔离检疫基地”通过国家计委立项。该项目总投资315万元，是全国仅有两个点中设在南方的一个。 该基地1992年9月通过国家鉴定验收，并正式投入使用。

1987年：厦门华侨植物联络会成立，联络会会长由厦门市侨办主任林华明兼任。

2000年：通过厦门市市属科研院所科技体制改革，定性为非营利性公益类科研机构。

2004年：厦门华侨亚热带植物引种园划归厦门市鼓浪屿—万石山风景区管委会和厦门市侨办双重领导，业务由厦门市科技局主管。

2004年：确立全面落实科学发展观，走产学研结合道路，构建植物引种与检疫学科体系，依托“农作物国外引种隔离检疫基地”科研技术条件，建设厦门市植物引种检疫与天然产物研发重点实验室的科研计划行动。2005年：全面实施“以科研为主，科普为辅，适当发展旅游，重点突出“亚热带植物” 和“引种园”的特色的观光园建设。

2006年：获得“厦门市科普教育基地”荣誉称号。

2007年：建成了引种热带果树、南方药用植物和观赏植物三大特色专类园区。

2008年：获得“福建省科普教育基地”荣誉称号。

2009年:确立全面落实科学发展观，走产学研结合道路，构建植物引种与检疫学科体系，依托“农作物国外引种隔离检疫基地”的科研技术条件，于2009年4月组织申报“厦门市植物引种检疫与植物源产物重点实验室”。

2009年：与华侨大学化工学院共建了”生化与分子生物学专业硕士研究生联合培养点”，拥有2位硕士生导师，正式开始招生培养硕士研究生。

2009年：与厦门国际航空港花卉有限公司联合建立了“兰花脱毒种苗与遗传育种研究中心”。

2009年：与厦门绿色乡村生态科技有限公司合作建立了70亩“南亚热带果树推广示范基地”。

2010年:“厦门市植物引种检疫与植物源产物重点实验室”于当年7月通过了由厦门市科技局组织的专家评审验收。

2011年:厦门华侨亚热带植物引种园划归厦门市科技局领导，业务由福建省亚热带植物研究所主管。

2012年：引种园副主任、明艳林副研究员申报的《抗癌植物新药-柯里拉京抑制卵巢癌生长转移的分子机制研究》项目获得国家自然科学基金面上项目资助，编号：81274149。

2013年：引种园申报的《福建省对台种质资源隔离检疫共性技术平台及亚热带珍稀种质资源库的建设》项目获得财政部中央补助地方科技基础条件专项资金的资助，资助金额200万元。2013年：“厦门市植物引种检疫与植物源产物重点实验室”在厦门市科技局进行的2011-2012厦门市重点实验室评估中并评为优秀，并获得65万元的专项资金资助（以科研项目《基于抗癌新药-柯里拉京的植物资源筛选和柯里拉京的制备工艺研究 》形式资助，编号3502Z20130038）。

2014年：引种园申报的《境外珍稀热带、亚热带经济植物种质资源库的完善及其种子库和种子标本馆建设》项目获得财政部2014年中央引导地方科技发展专项资金的资助，资助资金400万元。

2018年：2018年7月20-8月20日，“美丽中国，自然lian接”博物绘画全国巡展厦门站引种园顺利举办。此次巡展是以生态绘画大师曾孝濂先生为首联合年轻一代的生态主题画家带领大家走进美丽中国的博物绘画世界，共展出16位国内知名植物画家近50幅精美作品，其中包含了第19届国际植物学大会植物艺术画展参赛及获奖作品。植物科学画既能精准的反映植株和器官的形态特征，也能达到科学与艺术融为一体、和谐统一。希望通过植物科学画展览，让民众体察到艺术家潜心创作时的平和心态以及面对艺术的真诚态度，能感受到他们对科学的尊重、对技艺的敬畏，也同时了解生物多样性的重要性，呼吁人们更多的关爱地球、热爱自然、保护生态、保护家园。

2018年：2018年11月，引种园申报的《珍稀热带、亚热带植物种质资源库条件建设》项目获得中央引导地方科技发展专项资金的资助，资助资金50万元。

2018年：2018年6月，引种园国外引种热带果树资源正式加入国家林业部林木种质资源平台，成为该平台在福建设立的子平台之一（项目编号：2018-58）。