2013年8月，我园申报的《福建省对台种质资源隔离检疫共性技术平台及亚热带珍稀种质资源库的建设》项目获得财政部2013年中央补助地方科技基础条件专项资金的资助，资助金额200万元。

该项目是在我园现有科研业务和科研平台基础上，围绕植物资源学科建设方向，以珍稀植物种质资源的引种驯化、隔离检疫和生物多样性保护为目标，重点在我园现有的果树资源和南药资源基础上，继续在世界范围内进行引种驯化、迁地保护，最终在我园建设我国亚热带植物（重点为果树和南药）珍稀资源库，使之成为我国植物资源战略性储备基地之一。同时，鉴于海峡两岸种质资源交流频繁，对台种质资源隔离检疫迫在眉睫，将在原国家隔离检疫基地基础上，建设福建省对台植物种质资源指定隔离检疫基地，最终使之成为服务两岸植物资源交流的公共技术研发平台。

本项目计划建设的我国亚热带珍稀植物种质资源库，将成为我国亚热带植物资源战略性储备基地之一；同时结合厦门市鼓浪屿申报世界文化遗产，进行厦门鼓浪屿引种植物园建设，通过园林布局和植物景观配置以展示鼓浪屿植物多样性，和华侨引种的文化和爱国历史，使之成为厦门市乃至全国重要的科普教育基地和爱国主义教育基地。 同时在原国家农作物国外引种隔离检疫基地的基础上、修缮并完善国家隔离检疫基地，成为福建省对台植物种质资隔离检疫基地，最终使之成为服务两岸植物资源交流的公共技术研发平台、检测服务平台。